Somos un colectivo transdisciplinario conformado por estudiantes, graduados, docentes y trabajadores de la ciencia, en su mayoría de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la UBA. Trabajamos en torno a problemáticas asociadas con el agua en lugares social y ambientalmente relegados. Nos organizamos de manera horizontal y mediante consensos.

En la búsqueda de una ciencia comprometida con las problemáticas y necesidades populares, construimos conocimientos de forma conjunta con organizaciones que trabajan por el cambio social. A su vez, desde el ámbito universitario impulsamos la interacción entre la docencia, la extensión y la investigación de acuerdo a esta manera de entender la ciencia, promoviendo un debate crítico sobre el modelo actual de universidad


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viernes, 13 de agosto de 2010

Análisis Microbiológicos

ANÁLISIS MICROBIOLÓGICOS - DÍA A DÍA




DÍA 1

Materiales

Aerobios totales
Pseudomonas
Placas de Petri con Agar para
conteo (APC): 3 por muestra

Monitores para la Filtración
Medio de cultivo Cetrimida
Rastrillos
Bomba de vacío y Kitasato
Placas de vidrio con alcohol
Flujo Laminar
Mecheros
Guantes
Contaminación cloacal
Tubos de ensayo grandes con 10ml de caldo Brila Fluorocult 2X y campana de Durham: al menos 3 por muestra
(Preferentemente más para diluciones y control negativo).

Tubos de ensayo chicos con 5ml de caldo Brila Fluorocult 1X y campana de Durham: al menos 6 por muestra
(Preferentemente más para diluciones y control negativo).

General
Tips estériles azules y amarillos
Estufa a 37ºC
Micropipetas P200 y/o P1000
Espadol
Pipetas estériles de 10ml
(con perita o propipetas)
Algodón
Guardapolvo
Agua estéril
Bolsa roja para descarte de patogénicos
Marcador indeleble
Cinta de papel






Desarrollo

Aerobios totales
1.    Se siembran dos placas por muestra. Agitar bien las muestras y sembrar 0,1ml de cada una, rastrillar y dejar a 37ºC por 48hs.
2.    Incluir un control negativo con agua estéril.
Si se sospecha que la muestra puede tener alta cantidad de bacterias aerobias (muestra muy turbia), diluirla (por ej. 1:2 y 1:5) y sembrar 0,1ml de las diluciones.



Pseudomonas
1.    Armar el frasco del kit (“monitor”) en el dispositivo de filtración.
2.    Agitar bien la muestra y volcar 100 ml de la misma en el monitor.
3.    Filtrar.
4.    Desensamblar la base del monitor y colocarle la tapa. La parte del medio se descarta.
5.    Inyectar por abajo el medio de cultivo (Agar Cetrimida). Dar tiempo a que el filtro se embeba bien antes de retirar el dispositivo.
6.    Tapar el orificio.
7.    Incubar la placa 48hs a 37°C
Contaminación cloacal
1.    Agitar enérgicamente la muestra.
Si la muestra es demasiado turbia, es aconsejable diluirla (por ej. 1:2 y 1:5) y sembrarlas junto a la muestra sin diluir.
2.    Sembrar por cada muestra:
3 tubos de 10ml de caldo Brila 2X con 10ml de muestra.
3 tubos de 5ml de caldo Brila 1X con 1ml de muestra.
3 tubos de 5ml de caldo Brila 1X con 0,1ml de muestra.
Agitar la muestra entre siembra y siembra para evitar que se depositen las bacterias.
3.    Incluir un juego de tubos sembrados con agua estéril, como control negativo.
4.    Incubar 48hs a 37ºC sin agitación.




DÍA 2

Materiales

Pseudomonas
General
Lámpara UV
Bolsa roja para descarte de patogénicos
Anteojos protectores para luz UV
Guantes y guardapolvo



Desarrollo

Aerobios totales
  1. Mirar las placas y fijarse si crecieron hongos, que pueden colonizar toda la placa y dificultar el recuento de colonias. Si es así, tratar de contar las Unidades Formadoras de Colonias (UFCs) ese mismo día (las colonias son chiquitas, pero pueden detectarse por diferente refringencia a contraluz).
  2. Guardar las placas en heladera
Pseudomonas
  1. Iluminar el filtro con luz UV a 265 nm (¡protegerse los ojos!).
  2. Realizar el recuento de colonias fluorescentes.
  3. Guardar las placas en heladera
Contaminación cloacal
  1. Observar los tubos y anotar el número de positivos para coliformes por muestra (crecimiento y gas en al menos 1/3 de la campana). Los no coliformes muestran crecimiento pero no gas.
Para que el ensayo sea válido, la mayoría de los tubos de menor concentración deben ser negativos para gas y positivos para crecimiento. Descartar las diluciones que no cumplan esta condición.
  1. Determinar con la tabla el número más  probable (X) de coliformes totales cada 100ml de muestra.
  2. Descartar los tubos negativos y guardar los positivos en heladera.




DÍA 3

Materiales

Pseudomonas
General
Placas con agar cetrimida:
3 o 4 por cada placa positiva

Bolsa roja para descarte de patogénicos
Guantes
Estufa a 43ºC
Guardapolvo
Contaminación cloacal
Tubos de caldo citrato de Koser:
1 por tubo de Brila sembrado


Espadol y algodón
Estufa a 37ºC
Ansas rectas
Marcador indeleble y cinta de papel



Desarrollo

Aerobios totales
  1. Recuento de colonias. Si se sembraron 0,1ml, se debe multiplicar el valor por 10, para informar aerobias totales por ml.
La muestra se considera contaminada si supera las 500 UFCs/ml en promedio de las placas (para poder promediar las placas, los valores deberían ser similares). Esto representa 50 colonias por placa.
Si hay más de 200 colonias, es aconsejable contar UFCs en una placa donde se haya sembrado una muestra más diluida.
  1. Descartar las placas en bolsa roja.
Pseudomonas
  1. Repicar las colonias positivas (3 o 4 por muestra) a placas de agar cetrimide
  2. Incubar a 43ºC durante 24-48hs
Contaminación cloacal
  1. De los cultivos positivos para crecimiento y gas, se siembra una ansada en caldo citrato de Koser. Usar ansa recta para llevar la menor cantidad posible de medio Brila al caldo citrato (que sólo debe tener citrato como fuente de carbono).
  2. Incluir un control negativo con un caldo Brila que no muestre crecimiento (o agua estéril).
  3. Incubar a 37ºC durante 48hs.
  4. Devolver los tubos con caldo Brila a la heladera



DÍA 4

Materiales

General
Bolsa roja para descarte de patogénicos
Guardapolvo
Guantes



Desarrollo

Pseudomonas
Pasar las muestras de la estufa a la heladera
Contaminación cloacal
  1. Agitar y observar los tubos de caldo citrato de Koser. Se consideran coliformes no fecales (pueden crecer con citrato como única fuente de carbono) si hay turbidez.
  2. Obtener el número más probable (NMP) de coliformes no fecales (b).
  3. Descarte de los tubos de citrato de Koser.



DÍA 5

Materiales

Pseudomonas
Contaminación cloacal
Cloroformo y tubos
Reactivo de Kovacs
General
Bolsa roja para descarte de patogénicos
Guantes
Lámpara UV
Guardapolvo
Anteojos protectores para luz UV
Lavandina



Desarrollo

Pseudomonas
Realizar la extracción del pigmento piocianina por extracción con cloroformo:
  1. Colocar 1-2 ml de cloroformo en cada placa positiva
  2. Traspasar a un tubo limpio (se debería observar a simple vista un color azulado)
  3. Observar fluorescencia con la utilización de una lámpara UV portátil.
  4. Descartar las placas en bolsa roja.
Contaminación cloacal
  1. Mirar los tubos positivos con luz UV. Si se observa fluorescencia azul (producida por un producto de clivaje del MUG) se consideran positivos para coliformes fecales y Escherichia coli.
  2. Para corroborar que sea E. coli, se realiza la prueba del indol (que detecta productos metabólicos del triptofano), agregando 0,1ml de reactivo de Kovacs.
Si se observa viraje al rojo en la superficie, es positivo. NO AGITAR.
  1. Se puede ir agregando reactivo si con 0,1 ml no se alcanza a ver el color del mismo.
  2. Obtener el número más probable (NMP) de coliformes fecales (a).
  3. Corregir los datos según la siguiente fórmula:                                    
    # Coliformes fecales/100ml = X * a / (a+b)
    # Coliformes no fecales/100ml = X * b / (a+b)
  4. Descartar en bolsa roja y dejar los tubos con lavandina 10%.


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